1、这两者同为低分子金属硫酸盐，但其所含金属离子不同，一个为铝离子，一个为铁离子，因此从外观上看一个为无色，另一个则为黄绿色（亚铁离子在空气中及易被氧化）或蓝绿色。
 2、成本差异，从单价上看，硫酸亚铁价格相对要低很多，当然投加量也会相应增加。
 3、硫酸亚铁具有还原性，可以废水处理中对色素等物质进行还原处理；硫酸铝不属于酸性或碱性，在废水脱色中主要作为混凝剂使用。
 4、作用不尽相同，如硫酸铝可用于废水去臭，而硫酸亚铁则可与双氧水一起进行芬顿处理。
 5、作用效果不同。相对来说，硫酸亚铁所形成的矾花比较小且轻，容易在曝气下产生上浮或悬浮在废水中。因此，在曝气工艺中铝盐比铁盐更具优势。
 6、两者虽同为酸性药剂，在污水处理中多应用于中性或偏碱性pH值条件下，但硫酸铝为两性物质，当水中pH值达到其作用值时，碱性继续增强，则会使所形成的氢氧化铝胶体及絮体重新溶解、解体。